Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms