Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms