Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85CA6NKD9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms