Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms