Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6BA6NDN3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6BA6NDN3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms