Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD2APQ9Y5K6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms