Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRG3Q9Y2Y8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRG3Q9Y2Y8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms