Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
THRAP3Q9Y2W1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP3Q9Y2W1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms