Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1DQ9Y2S0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms