Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDCQ9Y266 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDCQ9Y266 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms