Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms