Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PNMA8BQ9ULN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA8BQ9ULN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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