Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC23Q9UJX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms