Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSKSQ9UJT2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSKSQ9UJT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms