Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms