Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00527Q9UJ94 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00527Q9UJ94 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms