Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms