Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms