Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms