Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms