Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXTL2Q9UBQ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms