Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC6Q9UBN7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC6Q9UBN7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms