Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MBD2Q9UBB5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms