Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP35Q9P2H5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP35Q9P2H5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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