Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNIP2Q9P278 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms