Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NOP53Q9NZM5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms