Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMOD3Q9NYL9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMOD3Q9NYL9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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