Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A4Q9NY91 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A4Q9NY91 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms