Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30AQ9NV96 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms