Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMILIN3Q9NT22 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMILIN3Q9NT22 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms