Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPMQ9NSP4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms