Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARHGEF4Q9NR80 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF4Q9NR80 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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