Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM7Q9NR12 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms