Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BIN3Q9NQY0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms