Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTN4Q9NQC3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTN4Q9NQC3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms