Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB18Q9NP72 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms