Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMX1Q9NP08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMX1Q9NP08 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms