Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C6orf50Q9HD87 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf50Q9HD87 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms