Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSTN2Q9H4D0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSTN2Q9H4D0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms