Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC90BQ9GZT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms