Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE41Q9C0J9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms