Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms