Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms