Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms