Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTA3Q9BTC8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms