Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS4Q9BT78 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS4Q9BT78 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms