Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYM1Q9BRP8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms