Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms