Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MGME1Q9BQP7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGME1Q9BQP7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGME1Q9BQP7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGME1Q9BQP7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGME1Q9BQP7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGME1Q9BQP7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms