Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms